در قسمتی از ضلع غربی محوطه بیرونی مجموعه بقعه شیخ صفی الدین اردبیلی این موزه در یک ساختمان دو طبقه و وسیع و به متراژ ۱۷۰۰ متر مربع و قریب به ۱۰ سال هست که افتتاح شده در طبقه اول پس از ورود ابتدا به کتیبه اصلی بالای بارگاه شیخ صفی که پس از تخریب و زلزله قطعاتی از آن باقی مانده و به این مکان منتقل شده برمی خورید،در طبقه اول موزه سکه که از دوران قبل از اسلام و ساسانی و امپراطوری بیزانس تا دوره های مختلف تا عصر قجار رو رویت میکنید،در قسمتی از طبقه اول و بخش عمده طبقه زیر زمین آثار مختلف سفالی و فلزی از دوران هخامنشیان و ساسانیان تاپس از اسلام جذابیتهای زیادی رو ایجاد کردن،در سمت شرقی زیرزمین ابتدا دیواری شامل نقشه ها و عکسهای تاریخی از اردبیل قدیم رو به نمایش گذاشتن ودر جنب اون از دوره اشکانی و از منطقه ای به نام بوینی یوغون اسکلت زنی که به صورت جنینی آرمیده قرار داره مشابه این روش دفن رو در موزه همدان هم دیده بودم،لازم به توضیحه که در ایران باستان فلسفه این نوع خاکسپاری به صورت خمیده و جنینی( همانند جنیین در شکم مادر) و رو به مشرق و جهت طلوع خورشید اعتقاد به زندگی پس از مرگ در باور نیاکان ما بوده.